3'-processing Analysis of S. cerevisiae mRNA Sequences

Tools
Sites in User Submitted Sequence
Sites in Known Genes
Check Results

Documentation
Output Format
Overview Plot
Top Sites
Full Site Detail

DSM/HMM Used
DSM Overview Plot
Empirical Positions
Nucleotide Frequency

Individual Element Nucleotide Frequencies

Element 1(e1)
     A      C      G      T
1  0.028  0.034  0.026  0.912
2  0.805  0.031  0.123  0.041
3  0.046  0.158  0.022  0.774
4  0.669  0.019  0.253  0.059
5  0.024  0.044  0.028  0.904
6  0.962  0.012  0.014  0.012

Element 2(e2)
     A      C      G      T
1  0.558  0.114  0.036  0.291
2  0.828  0.030  0.111  0.031
3  0.268  0.076  0.074  0.582
4  0.722  0.048  0.169  0.061
5  0.543  0.142  0.035  0.279
6  0.624  0.161  0.103  0.113

Element 3(e3)
     A      C      G      T
1  0.048  0.162  0.118  0.672
2  0.309  0.083  0.129  0.479
3  0.199  0.164  0.037  0.600
4  0.207  0.095  0.093  0.605
5  0.195  0.142  0.076  0.587
6  0.075  0.176  0.139  0.610

Cleavage (c)
     A      C      G      T
1  0.257  0.173  0.120  0.450
2  0.034  0.243  0.162  0.560
3  0.713  0.086  0.046  0.155
4  0.412  0.157  0.089  0.342
5  0.317  0.161  0.133  0.389

A      C      G      T
1  0.244  0.210  0.047  0.499
2  0.124  0.141  0.102  0.633
3  0.098  0.197  0.103  0.602
4  0.106  0.147  0.096  0.651
5  0.133  0.091  0.160  0.616
6  0.067  0.224  0.112  0.597